Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms