Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms