Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm1Q2TV84 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm1Q2TV84 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms