Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ush2AQ2QI47 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms