Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms