Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox4fQ2MDF8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4fQ2MDF8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms