Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms