Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fgfbp3Q1HCM0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fgfbp3Q1HCM0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms