Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam171bQ14CH0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam171bQ14CH0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms