Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptcd3Q14C51 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptcd3Q14C51 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms