Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Tdrd9Q14BI7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms