Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Perm1Q149B8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms