Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms