Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms