Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpne7Q0VE82 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms