Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms