Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms