Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab42Q0PD08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms