Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms