Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms