Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc21bQ0HA38 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms