Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms