Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc4Q08624 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 828.4 ms