Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm3Q08189 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms