Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ebf1Q07802 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ebf1Q07802 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ebf1Q07802 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ebf1Q07802 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms