Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MestQ07646 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MestQ07646 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MestQ07646 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MestQ07646 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MestQ07646 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms