Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col17a1Q07563 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms