Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms