Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox4Q06831 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms