Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms