Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs3Q05895 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms