Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Fmn1Q05860 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fmn1Q05860 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms