Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox12Q04890 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox12Q04890 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms