Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms