Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms