Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp1Q03401 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp1Q03401 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms