Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp11Q02853 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms