Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1sQ02789 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms