Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col6a2Q02788 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms