Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms