Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms