Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VcpQ01853 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VcpQ01853 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms