Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms