Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms