Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja5Q01231 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja5Q01231 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms