Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms