Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2bQ01097 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2bQ01097 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2bQ01097 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2bQ01097 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2bQ01097 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms