Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde1bQ01065 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms