Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms