Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col8a1Q00780 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms